Structure and function of the global ocean microbiome - Université Pierre et Marie Curie Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Science Année : 2015

Structure and function of the global ocean microbiome

Samuel Chaffron
Karine Labadie
Bardya Djahanschiri
  • Fonction : Auteur
Adriana A. Alberti
Francisco M. Cornejo-Castillo
  • Fonction : Auteur
Paul I. Costea
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Corinne Cruaud
Isabel Ferrera
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Lionel Guidi
Florian Kokoszka
  • Fonction : Auteur
Gipsi Lima-Mendez
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Julie Poulain
Bonnie T. Poulos
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Marta Royo-Llonch
  • Fonction : Auteur
Hugo Sarmento
Sara Vieira-Silva
Céline Dimier
  • Fonction : Auteur
Sarah Searson
  • Fonction : Auteur
Chris Bowler
Pascal Hingamp
Daniele Iudicone
Hiroyuki Ogata
Stéphane Pesant
  • Fonction : Auteur
Sabrina Speich
  • Fonction : Auteur
Lars Stemmann
Matthew B. Sullivan
  • Fonction : Auteur
Patrick Wincker
Silvia G. Acinas
  • Fonction : Auteur

Résumé

Microbes are dominant drivers of biogeochemical processes, yet drawing a global picture of functional diversity, microbial community structure, and their ecological determinants remains a grand challenge. We analyzed 7.2 terabases of metagenomic data from 243 Tara Oceans samples from 68 locations in epipelagic and mesopelagic waters across the globe to generate an ocean microbial reference gene catalog with >40 million nonredundant, mostly novel sequences from viruses, prokaryotes, and picoeukaryotes. Using 139 prokaryote-enriched samples, containing >35,000 species, we show vertical stratification with epipelagic community composition mostly driven by temperature rather than other environmental factors or geography. We identify ocean microbial core functionality and reveal that >73% of its abundance is shared with the human gut microbiome despite the physicochemical differences between these two ecosystems.
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Sunagawa_et_al_2015_preprint.pdf (2.06 Mo) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-01233742 , version 1 (14-04-2021)

Identifiants

Citer

Shinichi Sunagawa, Luis Pedro Coelho, Samuel Chaffron, Jens Roat Kultima, Karine Labadie, et al.. Structure and function of the global ocean microbiome. Science, 2015, 348 (6237), pp.1261359. ⟨10.1126/science.1261359⟩. ⟨hal-01233742⟩
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