Patterns and ecological drivers of ocean viral communities - Université Pierre et Marie Curie Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Science Année : 2015

Patterns and ecological drivers of ocean viral communities

Simon Roux
Samuel Chaffron
Josep Gasol
Ann Gregory
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Lionel Guidi
Pascal Hingamp
Daniele Iudicone
Hiroyuki Ogata
Bonnie Poulos
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Sarah Schwenck
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Chris Bowler
Matthew Sullivan
C. Ignacio-Espinoza
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M. Gasol
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C. Gregory
  • Fonction : Auteur
M. Schwenck
  • Fonction : Auteur

Résumé

Viruses influence ecosystems by modulating microbial population size, diversity, metabolic outputs, and gene flow. Here, we use quantitative double-stranded DNA (dsDNA) viral-fraction metagenomes (viromes) and whole viral community morphological data sets from 43 Tara Oceans expedition samples to assess viral community patterns and structure in the upper ocean. Protein cluster cataloging defined pelagic upper-ocean viral community pan and core gene sets and suggested that this sequence space is well-sampled. Analyses of viral protein clusters, populations, and morphology revealed biogeographic patterns whereby viral communities were passively transported on oceanic currents and locally structured by environmental conditions that affect host community structure. Together, these investigations establish a global ocean dsDNA viromic data set with analyses supporting the seed-bank hypothesis to explain how oceanic viral communities maintain high local diversity.
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Dates et versions

hal-01768331 , version 1 (08-01-2024)

Identifiants

Citer

Jennifer Brum, J Cesar Ignacio-Espinoza, Simon Roux, Guilhem Doulcier, Silvia G. Acinas, et al.. Patterns and ecological drivers of ocean viral communities. Science, 2015, 348 (6237), pp.1261498. ⟨10.1126/science.1261498⟩. ⟨hal-01768331⟩
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