Solution structure study of a proline-rich decapeptide.
Résumé
Le décapeptide VPPPVPPRRR (V10R) correspond à une région de la protéine Sos (Son of sevenless) capable de se lier aux deux domaines SH3 de Grb2 avec une affinité de l'ordre du μM [Y. Jacquot, I. Broutin, E. Miclet, M. Nicaise, O. Lequin, N. Goasdoue, C. Joos, P. Karoyan, M. Desmadril, A. Ducruix, S. Lavielle, Bioorg. Med. Chem. 15 (2007) 1439]. Cette interaction est une étape clé dans les phénomènes de signalisation, puisqu'elle est située en amont de la voie des MAP-kinases qui contrôle les processus de prolifération et de différenciation cellulaire. Il a été montré qu'au sein du complexe V10R/Grb2, le peptide adoptait une conformation de type hélice polyproline II (PPII) entre les résidus Pro2 et Pro7 [N. Goudreau, F. Cornille, M. Duchesne, F. Parker, B. Tocqué, C. Garbay, B.P. Roques, Struct. Biol. 1 (1994) 898]. Une étude structurale par RMN et dichroïsme circulaire dans l'UV lointain du peptide V10R libre est présentée ici. Bien que comptant cinq résidus proline, nos résultats indiquent que seulement deux ensembles de conformères sont présents en solution, dont l'un représente 91% de la population et est replié dans une conformation très similaire à la conformation active (RMSD = 0,96 Å).